1. Polytetrafluóretylénová membrána je vyrobená z PTFE, ktorý je úplne prirodzene hydrofóbny. Dokonca aj pri veľmi nízkom tlakovom rozdiele môže zabezpečiť nerušený prechod vlhkého vzduchu alebo iných plynov, zatiaľ čo vodný roztok nemôže prejsť. Jeho výkon je presne opačný ako u hydrofilnej membrány. PTFE filtračná membrána má silnú chemickú kompatibilitu a je vhodná na filtráciu takmer všetkých organických rozpúšťadiel a silne korozívnych chemikálií. Keď sa vodný roztok musí prefiltrovať pomocou PTFE filtračnej membrány, vodný roztok možno prefiltrovať len po predbežnej infiltrácii etanolom alebo izopropanolom.
2. Predfiltračná membrána zo sklenených vlákien (GF): používa sa na zlepšenie rýchlosti filtrácie a kontinuálnej filtrácie; Filtračná membrána zo sklenených vlákien patrí k hĺbkovej filtrácii, ktorá sa používa hlavne ako predfiltračná vrstva a priamo sa pridáva na filtračnú membránu.
3. Nylonová filtračná membrána (polyamid, nylon): používa sa na filtrovanie alkalických roztokov a organických rozpúšťadiel;
Nylonová membrána má veľmi dobrú mechanickú pevnosť a silnú adsorpciu. Znesie väčšinu organických rozpúšťadiel a väčšinu alkalických roztokov. Je vhodný najmä na filtráciu alkalických roztokov. Na filtráciu organických rozpúšťadiel, ako je filtrácia častíc pomocou mobilnej fázy HPLC, je nylonová membrána ekonomickejšia a praktickejšia ako membrána PTFE. Okrem toho môže byť ako prenosová membrána použitá aj nylonová membrána. Vzhľadom na relatívne vysoký adsorpčný výkon nylonovej membrány sa vo všeobecnosti neodporúča používať na filtráciu kultivačného média alebo biologických vzoriek, ako je proteínový roztok, aby sa predišlo strate vzoriek v dôsledku adsorpcie. V tomto prípade sa zvyčajne používa membrána z acetátu celulózy (CA) s nízkou adsorpciou, ktorá je vhodnejšia.
